Los usuarios de GNU/Linux están al tanto del hecho de que en sus máquinas los distintos programas se ubican en distintas partes del árbol de directorios. GoboLinux es una distribución (disponible en LiveCD) que propone la alternativa de ubicar todos los programas en el mismo sitio, ya que con esta estructura más lógica, según apuntan sus desarrolladores, será más fácil gestionar los programas que tenemos instalados en la misma.

La idea que proponen es guardar todos los programas en un mismo directorio, dentro del cual cada uno tendrá sus propios archivos en sus correspondientes subdirectorios. Para gestionar la estructura jerárquica de los distintos programas se utiliza una gestión de índices a través de directorios que sólo contienen enlaces a los programas del directorio principal. La distribución se ocupa de la gestión de enlaces rotos de manera que siempre estén sincronizados con los que estén instalados en la máquina. De esta manera se garantiza la compatibilidad con sistemas UNIX, además de aportar ventajas como la posibilidad de compartir distintas versiones de un mismo programa. Característica que podría resolver los clásicos problemas de dependencias tan comunes en algunas distribuciones.